Desa Mulyamekar terbentuk pada era tahun 1980-an, sebagai hasil pemekaran dari wilayah administrasi yang lebih luas di Kecamatan Babakancikao. Nama "Mulyamekar" sendiri diambil dari filosofi dan doa para tokoh masyarakat dan sesepuh desa kala itu.

Kata "Mulya" bermakna mulia, luhur, atau berharga, sedangkan "Mekar" berarti berkembang, tumbuh, atau harum. Dengan demikian, Mulyamekar mengandung doa agar desa ini terus tumbuh menjadi wilayah yang luhur derajatnya, makmur warganya, dan namanya harum di mata masyarakat luas.

Seiring berjalannya waktu, Mulyamekar terus bertransformasi dari desa agraris menjadi kawasan yang dinamis. Kini, dengan pemanfaatan teknologi digital, Pemerintahan Desa Mulyamekar melangkah maju untuk memberikan pelayanan administrasi yang cepat, tepat, dan modern bagi seluruh warganya.